Extenzivně rezistentní kmeny M. tuberculosis
Vyplynulo to z výsledků mezinárodní studie, která si kladla za cíl osekvenování kompletního genomu několika desítek kmenů M. tuberculosis. Databáze s genomy těchto kmenů byly zveřejněny na webových stránkách Broad Institute. Když byl projekt zahájen, kladli si jeho autoři z Broad Institute a Harvard School of Public Health za jeden z hlavních cílů získat dostatek podkladů pro rychlou a spolehlivou diagnostiku a následnou terapii multirezistentních kmenů M. tuberculosis (MDR-TB), na jejichž konto připadá ročně 450 000 nových infekcí.
Na využití objevů v praxi si ještě počkáme
Kmeny XDR-TB se objevily teprve před několika lety a Světová zdravotnická organizace (WHO) odhaduje počet lidí infikovaných XDR-TB na 27 tisíc. Odborníci jsou přesvědčeni, že údaj je silně podhodnocený, protože diagnostika XDR-TB je obtížná a většina případů není vůbec podchycena. K sekvenovaným kmenům M. tuberculosis patří i ten, který má na svědomí dosud nejmasovější vzplanutí XDR-TB v jihoafrickém městě Tugela Ferry v provincii KwaZulu-Natal. Na přelomu let 2005 a 2006 tu onemocnělo 53 osob a 52 z nich zemřelo. Od té doby zaznamenali v tomto městě dalších více než 200 případů XDR-TB. Srovnání genomů ukázalo, že MDR-TB kmeny se od senzitivních kmenů M. tuberculosis liší devětadvaceti změnami jednotlivých písmen genetického kódu. Kmeny XDR-TB dělí od senzitivních kmenů jen další čtyři změny písmen genetického kódu. Kromě těchto změn v jednotlivých nukleotidech se s rezistencí pojí i několik málo dalších typů mutací včetně inzercí a delecí.
Genetici pátrají v genomu kmenů MDR-TB a XDR-TB i po tzv. kompenzačních mutacích, které zvyšují životaschopnost M. tuberculosis v případech, kdy mutace zajišťující rezistenci vedou ke snížení životaschopnosti bakterie.
Podle Paula Nunna, který je koordinátorem WHO pro řešení problematiky rezistentních kmenů M. tuberculosis, je využití nových objevů pro potřeby diagnostiky MDR-TB a XDR-TB záležitostí několika dalších let výzkumu a vývoje.
Zdroj: