Přeskočit na obsah

Jan Trka: Nemáme dost na to, abychom platili každému, kdo tvrdí, že je vědec

jan trka
Foto archiv NÚVR, Markéta Tlustá

S vedoucím Laboratorního centra Kliniky dětské hematologie a onkologie 2. LF UK a FN Motol, Praha, které je zároveň součástí Národního ústavu pro výzkum rakoviny (NÚVR), prof. MUDr. Janem Trkou, Ph.D., jsme měli možnost krátce hovořit u příležitosti říjnového neformálního setkání výboru konsorcia EuroMRD v Praze.

  • Nemůžeme začít jinak než dotazem: jak je to správně? Minimální, jak bylo v literatuře obvyklé, nebo měřitelná reziduální nemoc?

Je pravdou, že termín „měřitelná“ se objevil až v posledních letech. Přišel ruku v ruce se zvýšeným zájmem amerických vědců a kliniků o danou problematiku a má dát najevo, že jsme schopni zbytkovou nemoc nejenom detekovat, ale i měřit její dynamiku. Takže logiku to má. Nicméně zkratka MRD zůstává stejná – ať už budeme mít na mysli postaru „minimal“, nebo nově „measurable“.

  • Asi bychom měli připomenout význam sledování měřitelné reziduální nemoci u hematologických malignit.

Měřitelná reziduální nemoc se například čím dál častěji používá v klinických studiích jako náhradní cíl, obzvláště u diagnóz s obecně velmi dobrou prognózou, u nichž přicházejí relapsy nebo recidivy až za velmi dlouhou dobu. V těchto případech by bylo velmi obtížné dělat klinickou studii, kde by konečným cílem bylo přežití pacientů, protože by musela trvat mnoho a mnoho let.

Měřitelná reziduální nemoc je ale především nástrojem pro řízení intenzity léčby. Již po indukční fázi se u akutních leukémií snažíme podle ní pacienty třídit do skupin s redukovanou, standardní a intenzifikovanou léčbou.

  • Což je důležité nejen s ohledem na výsledky, ale i na kvalitu života pacientů?

Samozřejmě. My se konkrétně hodně soustředíme na dětské leukémie, u kterých je pochopitelně prevence následků léčby, zejména těch pozdních, velice důležitá. Když se dnes díváme na křivky přežití dětských pacientů s akutní leukémií, vidíme skvělé výsledky. Ale kvalita života těchto dětí někdy už tak skvělá není – mají vyměněné klouby, prodělaly nějakou kardiotoxickou nebo nefrotoxickou léčbu… Takže se snažíme tu intenzitu terapie u nich redukovat a používat nové metody, třeba imunoterapii, které jsou mnohem šetrnější, a tím pádem jim zajistí lepší kvalitu pozdějšího života.

  • Setkáváme se během pražského neformálního setkání výboru konsorcia EuroMRD. Jaké je jeho poslání?

Konsorcium existuje už velmi dlouho, i když ne po celou dobu přesně pod tímto názvem, nicméně pracuje a vyvíjí se skutečně již tři dekády. Dnes sdružuje 74 laboratoří, zdaleka nejenom z Evropy, ale i z Asie, Severní a Jižní Ameriky. Jak název EuroMRD napovídá, konsorcium se zaměřuje na metody detekce reziduální nemoci, zejména na jejich technologické aspekty, protože nejsme v zásadě klinická skupina. Naším úkolem tedy není aplikovat výsledky měření reziduální nemoci do klinické praxe, ale připravit technologickou základnu pro to, aby se toto měření vůbec mohlo provádět. Například u dětských leukémií se MRD sleduje už 25 let, u dospělých minimálně 15 let také – to je výsledek naší práce.

  • O čem z hlediska české vědy vypovídá to, že vy osobně jste spolupředsedou konsorcia EuroMRD?

Je to vlastně jedním z přirozených důsledků toho, že jsme „byli u toho“ od samého začátku. V době, kdy se ještě česká věda příliš na evropském, natož světovém poli neprosazovala, jsme se tématu měření zbytkové nemoci chytili – a se zahraničními kolegy, kteří jsou dnes tady v Praze přítomni, spolupracujeme opravdu již déle než 25 let.

  • Co bylo cílem vašeho pražského meetingu?

Nešlo o zasedání výboru v pravém slova smyslu, to míváme v rámci našich pravidelných konferencí. Tohle bylo něco, co jsme nazvali retreatem – tedy setkání, kde máme více času mluvit o koncep­čních nových věcech než se zabývat aktuální administrativou a agendou.

  • Kterým otázkám jste se věnovali především? Je úkolem do budoucna dále zpřesnit senzitivitu nebo specificitu měření MRD? A jakými metodami, třeba sekvenováním nové generace?

Detekce zbytkové nemoci má přesně tyhle dva aspekty – citlivost a přesnost. Dnes se hodně mluví o zvyšování citlivosti, objevily se nové metody, zmínil jste se o sekvenování nové generace, ale i to, čemu se říká multiparametrická průtoková cytometrie. Když se použije velké množství buněk, dokáže se výrazně zvýšit citlivost. Ale jde o to, aby i na úrovni velmi citlivé detekce byla pořád zachována specificita, neboli abychom si byli jisti, že detekujeme opravdu leukemické buňky.

  • Významným příspěvkem vaší výzkumné skupiny k danému tématu je i publikace z listopadu loňského roku, která vyšla v časopisu Leukemia (viz box). Co je v ní z vašeho pohledu nejpodstatnější?

Ten článek je zajímavý z toho pohledu, že jsme využili metodiku měření zbytkové nemoci, kterou jsme se naučili u akutní lymfoblastické leukémie, a přenesli ji – i s léty ověřenou standardizací a interpretací výsledků – do oblasti akutní myeloidní leukémie. U ní detekce reziduální nemoci pořád probíhá jinými metodami, které jsou mnohem méně přesné, méně citlivé a které zdaleka nepokrývají specifika všech pacientů. S využitím genomických informací jsme našli cíle pro sledování zbytkové nemoci u více než 90 procent pacientů s AML, to zatím běžně nikdo nedělá.

  • V programu pražského setkání výboru konsorcia EuroMRD figuroval i bod „Nové“ nemoci. Co si pod ním máme představit – a proč ty uvozovky?

Protože o nové nemoci v pravém slova smyslu nejde. Naše konsorcium se ale snaží najít pro metody, které používáme a vyvíjíme pro měření zbytkové nemoci převážně u akutních leukémií, uplatnění i u diagnóz, kde se dosud běžně nepoužívaly. Konkrétně se otevírá široké pole využití u mnohočetného myelomu a chronické lymfocytární leukémie. A to jsou opravdu „velké“ hematologické malignity, kterými v porovnání s akutními leukémiemi trpí mnohem více lidí.

Kromě nádorů krve je zde ovšem ještě obrovská oblast solidních nádorů, kde detekce volné nádorové DNA nebo nádorových buněk cirkulujících v krvi může sloužit jako marker úspěšnosti léčby, respektive návratu onemocnění. Pro takzvané tekuté biopsie, liquid biopsy, máme z našich technologií rozhodně co nabídnout.

  • A výhled konsorcia EuroMRD dále do budoucna?

Naší snahou je stejným způsobem, jako jsme standardizovali klasickou metodu detekce MRD vyvinutou v devadesátých letech, standardizovat i metodu založenou na sekvenování nové generace. Dnes existuje komerční americké řešení od jedné firmy, která si tuto oblast v podstatě monopolizuje. My v EuroMRD věříme, že jsme schopni naše řešení dotáhnout do fáze, kdy bude standardizované, akademicky volně použitelné a v klinické praxi mnohem levnější než to komerční – a přitom bude poskytovat stejně dobrou informaci. Tak to je třeba jedno z témat, o kterých jsme diskutovali.

  • Opusťme teď problematiku konsorcia EuroMRD a vraťme se ještě k vám osobně. Evropská hematologická společnost (EHA) vám letos na svém červnovém výročním kongresu udělila cenu za mentoring a vzdělávání. Nabízí se tak otázka, jak je tomu dnes u nás se vzděláváním nových vědců?

Myslím, že v Česku bohužel spousta věcí nefunguje úplně optimálně. Jednou z věcí, které rozhodně optimálně nefungují, je doktorské studium. Kvalita se velmi liší podle jednotlivých pracovišť a jednotlivých školitelů a nejsme pořád schopni dát to na celostátní úrovni do pořádku, což mě velice mrzí. Na druhé straně vidím spoustu skvělých mladých vědců. Doktor Šeda z Brna například aktuálně dostal od již zmíněné Evropské hematologické společnosti významný grant pro mladé vědce, takže je vidět, že se v konkurenci evropských vědců úplně neztrácíme.

  • Kdybyste měl možnost alespoň jednu věc napravit, co by to bylo?

Jednoznačně oříznout podprůměrnou vědu v jejím financování. Nemáme prostě dost peněz na to, abychom zaplatili každého, kdo o sobě tvrdí, že je vědec. A dá se to docela dobře poznat. V každém oboru je nějaká metrika, která vám řekne, kdo je skutečně dobrý vědec a kdo není.

  • Takže chybí odvaha tyto metriky důsledně použít?

Rozhodně jde o tu odvahu. Ale my se toho u nás pořád hrozně bojíme…

  • Co je podle vás pro dobrou vědu nejdůležitější?

Mezinárodní spolupráce! Pokud neděláte nějakou opravdu jen velmi omezenou věc základního výzkumu, ale věnujete se translačnímu klinickému výzkumu, musíte mezinárodně spolupracovat – a to smysluplně. Konsorcium EuroMRD je skvělým příkladem, jak to funguje, jak přitahuje další a další zájemce z celého světa, aby metody, které vyvíjíme, mohli začít používat.

  • V této konstelaci se musím závěrem zeptat na úlohu jiného, v tomto případě národního konsorcia, jakým je NÚVR.

Myslím, že NÚVR má důležitou roli v propojení výzkumu v oblasti nádorů, nádorové biologie a translačního klinického výzkumu v Česku. Pokud ji má ale opravdu splnit, samozřejmě na to nestačí tři a půl roku, které jsou tomuto projektu vymezeny. Musí být trvalý, musí mít perspektivu, a pak teprve začne přinášet ovoce. Budeme doufat, že se najde cesta a prostředky, jak pokračovat dál.

Metoda na bázi genomické DNA změní měření zbytkové nemoci u dětské AML

Akutní leukémie jsou nejčastějším maligním onemocněním dětského věku. V minulých desetiletích se prognóza pacientů výrazně zlepšila – u dětí s akutní lymfoblastickou leukémií (ALL) dnes dosahuje míra pětiletého přežití přibližně 90 procent a s akutní myeloidní leukémií (AML) kolem 75 procent. Pokroku bylo dosaženo mimo jiné díky přizpůsobení intenzity léčby riziku jejího selhání, které je v současnosti primárně určováno přítomností genetických aberací a časnou odpovědí na léčbu na úrovni tzv. měřitelné reziduální nemoci (measurable residual disease, MRD).

Autoři práce publikované v časopise Leukemia 2023 (Žaliová et al.) uvádějí, že pro detekci MRD u ALL je nejčastěji používanou metodou kvantifikace specifických klonálních přestaveb imunoreceptorových genů IG/TR na úrovni genomové DNA (gDNA). V případě AML jsou však takovéto přestavby IG/TR vzácné a podobný univerzální genetický cíl pro detekci MRD u tohoto onemocnění neexistuje.

Téměř u všech případů AML lze ale najít různé primární klonální genetické aberace vhodné pro sledování MRD – aktuálně se nejčastěji jedná o fúzní geny PML::RARA, RUNX1::RUNX1T1CBFB::MYH11. Kvůli obtížnosti získání genomových sekvencí zlomu je k tomuto účelu v praxi dosud používána metoda kvantifikace fúzních transkriptů, tedy sledování MRD založené na messengerové RNA (mRNA). Měření je metodologicky poměrně jednoduché, neumožňuje však přesnou kvantifikaci množství reziduálních leukemických buněk vinou variability počtu kopií transkriptu v jednotlivých buňkách. Navíc se úroveň exprese fúzních genů mezi jednotlivými pacienty významně liší, což limituje citlivost detekce MRD.

Autoři navázali na svou předchozí práci, v níž u 23 pacientů s jedním subtypem AML prokázali, že genomové sekvence uvedených tří fúzních genů lze rychle a spolehlivě získat pomocí sekvenování nové generace (next‑generation sequencing, NGS) a že přístup založený na gDNA umožňuje i u AML citlivé sledování MRD.

V aktuálně publikované studii ověřili použitelnost a prognostickou hodnotu sledování MRD založeného na gDNA v neselektované kohortě 133 po sobě jdoucích dětských pacientů s různými subtypy AML. Prokázali při tom, že při použití NGS lze genetické cíle spolehlivě nalézt a sledování MRD založené na gDNA lze rutinně používat až u 90 procent pacientů se stejnou specificitou i senzitivitou, jako je tomu už řadu let u dětské ALL.

Zdroj: Zaliova M, Zuna J, Winkowska L, et al. Genomic DNA‑based measurable residual disease monitoring in pediatric acute myeloid leukemia: unselected consecutive cohort study. Leukemia. 2024;38(1):21–30. doi: 10.1038/s41375‑023‑02083‑9.

Sdílejte článek

Doporučené